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故事舞台发生在架空的城市──日本美空市美空町,除此之外还有魔女世界和魔法堂等.自称为"世界上最不幸的美少女"的春风DoReMi,一直相信这世界上有魔女,并希望自己成为魔女后可以向喜欢的人表白.有一天放学时,春风DoReMi经过一间名叫"新旗山莉卡魔法堂"的店铺.进入一探究竟时,碰巧拆穿了当时魔法堂的老板-"魔女莉卡"具有魔女身份,而导致她变成魔女青蛙.由于只有正式的魔女才可让魔女莉卡恢复原貌,为了帮助魔女莉卡回复原状,DoReMi成为了魔女见习生,并要在见习魔女9个级别(第9级至第1级)的考试中合格,从而取得魔女的象征──自己的水晶球,才能成为正式魔女.期间,初贵,爱子与DoReMi的妹妹泡泡,因为先后知道DoReMi是魔女见习生,为了不让DoReMi也变成魔女青蛙,因此也陆续成为魔女见习生.为了赚取使用魔力所需的魔法珠,所以要时常在魔法堂帮忙.期间也慢慢的参加升级试.在升级试的途中,Doremi等人获得了精灵陪伴.